Если после подключения M.2 SSD диска пропал основной диск
Допустим, у вас в компьютере установлен диск (HDD или SSD – неважно), подключённый по интерфейсу SATA. Вы решили докупить новый SSD диск с интерфейсом M.2 и поставить его дополнительно к первому. Вы вставляете новый M.2 диск в компьютер, а старый диск при этом перестаёт определяться как в операционной системе, так и в BIOS. Из-за чего такое бывает и что при этом делать?
Дело в том, что ваш M.2 диск, скорее всего, также работает по протоколу SATA , и для его работы необходимо как минимум два SATA порта. Диск M.2 «отбирает» себе ресурсы и отключает как минимум два SATA порта у вашей материнской платы, которые до этого использовались первым диском. Поэтому исходный диск больше не может работать.

Чтобы решить эту проблему, просто переключите ваш первый диск на другой ряд SATA разъёмов (конечно, если у вас стационарный ПК). Тогда ресурсы SATA шины распределятся между дисками без конфликтов, и ваш первый диск снова станет видеться в системе и восстановит нормальную работоспособность.
PS. Хорошие статьи, хоть и не касающиеся решения данной проблемы, про форм-фактор M.2: